MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 55759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	TCC	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
2	NC_021015	CACG	2	8	6010	6017	25 %	0 %	25 %	50 %	479155736
3	NC_021015	ACA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155736
4	NC_021015	CGAT	2	8	6138	6145	25 %	25 %	25 %	25 %	479155736
5	NC_021015	AT	3	6	6173	6178	50 %	50 %	0 %	0 %	479155736
6	NC_021015	TCC	3	9	6211	6219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
7	NC_021015	CTG	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155736
8	NC_021015	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155736
9	NC_021015	CCGA	2	8	6320	6327	25 %	0 %	25 %	50 %	479155736
10	NC_021015	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155736
11	NC_021015	ATCAC	2	10	6482	6491	40 %	20 %	0 %	40 %	479155736
12	NC_021015	CAT	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155736
13	NC_021015	CCT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
14	NC_021015	CAC	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155736
15	NC_021015	AC	3	6	6534	6539	50 %	0 %	0 %	50 %	479155736
16	NC_021015	GAT	2	6	6613	6618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155736
17	NC_021015	AAT	2	6	6733	6738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155737
18	NC_021015	AC	3	6	6742	6747	50 %	0 %	0 %	50 %	479155737
19	NC_021015	TCT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155737
20	NC_021015	AAAT	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	479155737
21	NC_021015	TCC	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155737
22	NC_021015	CAA	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155737
23	NC_021015	T	6	6	6859	6864	0 %	100 %	0 %	0 %	479155737
24	NC_021015	A	6	6	7078	7083	100 %	0 %	0 %	0 %	479155738
25	NC_021015	TCAA	2	8	7092	7099	50 %	25 %	0 %	25 %	479155738
26	NC_021015	A	7	7	7103	7109	100 %	0 %	0 %	0 %	479155738
27	NC_021015	GGT	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155738
28	NC_021015	ATG	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155738
29	NC_021015	CAG	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155738
30	NC_021015	CAAAGA	2	12	7532	7543	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479155738
31	NC_021015	AGT	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155738
32	NC_021015	GAA	3	9	7632	7640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155738
33	NC_021015	AAT	2	6	7648	7653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155738
34	NC_021015	TTC	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155739
35	NC_021015	ATA	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155739
36	NC_021015	TGC	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
37	NC_021015	GACA	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	479155739
38	NC_021015	CGC	2	6	7879	7884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155739
39	NC_021015	CTC	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155739
40	NC_021015	TA	3	6	7947	7952	50 %	50 %	0 %	0 %	479155739
41	NC_021015	ATC	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
42	NC_021015	TGC	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
43	NC_021015	AAT	2	6	8302	8307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155739
44	NC_021015	T	6	6	8401	8406	0 %	100 %	0 %	0 %	479155739
45	NC_021015	CTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155739
46	NC_021015	AT	4	8	8435	8442	50 %	50 %	0 %	0 %	479155739
47	NC_021015	CTG	2	6	8454	8459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
48	NC_021015	GCC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155739
49	NC_021015	ATAA	2	8	8515	8522	75 %	25 %	0 %	0 %	479155739
50	NC_021015	CTG	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
51	NC_021015	A	6	6	8567	8572	100 %	0 %	0 %	0 %	479155739
52	NC_021015	CAGC	2	8	8613	8620	25 %	0 %	25 %	50 %	479155739
53	NC_021015	ATAA	2	8	8653	8660	75 %	25 %	0 %	0 %	479155739
54	NC_021015	AT	3	6	8666	8671	50 %	50 %	0 %	0 %	479155739
55	NC_021015	TCA	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
56	NC_021015	CAGCC	2	10	8760	8769	20 %	0 %	20 %	60 %	479155739
57	NC_021015	ACT	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
58	NC_021015	CAGC	2	8	8875	8882	25 %	0 %	25 %	50 %	479155739
59	NC_021015	TGT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155739
60	NC_021015	CTG	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
61	NC_021015	AT	3	6	8991	8996	50 %	50 %	0 %	0 %	479155739
62	NC_021015	CGGGC	2	10	9035	9044	0 %	0 %	60 %	40 %	479155739
63	NC_021015	GTC	2	6	9050	9055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
64	NC_021015	TTG	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155739
65	NC_021015	TAA	2	6	10707	10712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
66	NC_021015	CTG	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155740
67	NC_021015	TTC	2	6	10787	10792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155740
68	NC_021015	GGA	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155740
69	NC_021015	ATG	2	6	10869	10874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
70	NC_021015	ATG	2	6	10884	10889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
71	NC_021015	ATT	2	6	10922	10927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
72	NC_021015	ATG	2	6	10961	10966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
73	NC_021015	A	6	6	11158	11163	100 %	0 %	0 %	0 %	479155740
74	NC_021015	AGA	2	6	11182	11187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
75	NC_021015	GCA	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155740
76	NC_021015	GAA	2	6	11258	11263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
77	NC_021015	GT	3	6	11302	11307	0 %	50 %	50 %	0 %	479155740
78	NC_021015	TGA	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
79	NC_021015	GCG	2	6	11403	11408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155740
80	NC_021015	TGA	2	6	11476	11481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
81	NC_021015	A	6	6	11488	11493	100 %	0 %	0 %	0 %	479155740
82	NC_021015	TGT	2	6	11523	11528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155740
83	NC_021015	TA	3	6	11664	11669	50 %	50 %	0 %	0 %	479155740
84	NC_021015	ATTT	2	8	11670	11677	25 %	75 %	0 %	0 %	479155740
85	NC_021015	AGA	2	6	11683	11688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
86	NC_021015	CAT	2	6	11701	11706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155740
87	NC_021015	ATA	2	6	11814	11819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
88	NC_021015	TTG	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155740
89	NC_021015	ATT	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
90	NC_021015	ATT	2	6	11895	11900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
91	NC_021015	TCG	2	6	11943	11948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155740
92	NC_021015	TAA	2	6	12004	12009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
93	NC_021015	GAA	2	6	12017	12022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
94	NC_021015	ATC	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155740
95	NC_021015	AATAAG	2	12	12086	12097	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479155740
96	NC_021015	GAAA	2	8	12109	12116	75 %	0 %	25 %	0 %	479155740
97	NC_021015	AGT	2	6	12145	12150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
98	NC_021015	TTAT	2	8	12226	12233	25 %	75 %	0 %	0 %	479155741
99	NC_021015	TTTTC	2	10	12246	12255	0 %	80 %	0 %	20 %	479155741
100	NC_021015	T	7	7	12269	12275	0 %	100 %	0 %	0 %	479155741
101	NC_021015	AGC	3	9	12287	12295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155741
102	NC_021015	GTT	2	6	12545	12550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155741
103	NC_021015	AG	3	6	12581	12586	50 %	0 %	50 %	0 %	479155741
104	NC_021015	ATG	2	6	12633	12638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155741
105	NC_021015	ATT	2	6	12767	12772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155741
106	NC_021015	TC	3	6	12791	12796	0 %	50 %	0 %	50 %	479155741
107	NC_021015	AAG	2	6	12826	12831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155741
108	NC_021015	GAT	2	6	12839	12844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155741
109	NC_021015	TCT	2	6	12852	12857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155741
110	NC_021015	T	6	6	12946	12951	0 %	100 %	0 %	0 %	479155741
111	NC_021015	TA	3	6	12984	12989	50 %	50 %	0 %	0 %	479155741
112	NC_021015	CAG	2	6	13204	13209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155742
113	NC_021015	GTG	2	6	13294	13299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155742
114	NC_021015	GAC	2	6	13328	13333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155742
115	NC_021015	AAG	2	6	13435	13440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155742
116	NC_021015	ATA	2	6	13454	13459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155742
117	NC_021015	GAT	2	6	13579	13584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
118	NC_021015	AAG	2	6	13650	13655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155743
119	NC_021015	ATG	2	6	13704	13709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
120	NC_021015	AGTG	2	8	13712	13719	25 %	25 %	50 %	0 %	479155743
121	NC_021015	TA	3	6	13764	13769	50 %	50 %	0 %	0 %	479155743
122	NC_021015	CAC	2	6	13821	13826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155743
123	NC_021015	TGA	2	6	13828	13833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
124	NC_021015	TGA	2	6	13861	13866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
125	NC_021015	TATGA	2	10	13880	13889	40 %	40 %	20 %	0 %	479155743
126	NC_021015	TAT	2	6	14013	14018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155743
127	NC_021015	TAT	2	6	14155	14160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155744
128	NC_021015	ATTT	2	8	14163	14170	25 %	75 %	0 %	0 %	479155744
129	NC_021015	ACA	2	6	14172	14177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155744
130	NC_021015	CAA	2	6	14222	14227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155744
131	NC_021015	TGAT	2	8	14245	14252	25 %	50 %	25 %	0 %	479155744
132	NC_021015	GCC	2	6	14263	14268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155744
133	NC_021015	GCT	2	6	14279	14284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155744
134	NC_021015	AG	3	6	14335	14340	50 %	0 %	50 %	0 %	479155744
135	NC_021015	TTG	2	6	14341	14346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155744
136	NC_021015	ATC	2	6	14364	14369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155744
137	NC_021015	ATC	2	6	14424	14429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155744
138	NC_021015	AGA	2	6	14472	14477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155744
139	NC_021015	TCTG	2	8	14580	14587	0 %	50 %	25 %	25 %	479155744
140	NC_021015	AAG	2	6	14676	14681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155744
141	NC_021015	AT	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	479155744
142	NC_021015	AAG	2	6	14745	14750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155744
143	NC_021015	AAT	2	6	14772	14777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155744
144	NC_021015	TCATCT	2	12	14860	14871	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479155744
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146	NC_021015	ATC	2	6	15058	15063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155744
147	NC_021015	GATG	2	8	15096	15103	25 %	25 %	50 %	0 %	479155744
148	NC_021015	CAA	2	6	15920	15925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155745
149	NC_021015	AAGA	2	8	15989	15996	75 %	0 %	25 %	0 %	479155745
150	NC_021015	GAGAA	2	10	16194	16203	60 %	0 %	40 %	0 %	479155746
151	NC_021015	ATC	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155746
152	NC_021015	GAA	2	6	16251	16256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
153	NC_021015	A	8	8	16255	16262	100 %	0 %	0 %	0 %	479155746
154	NC_021015	AGG	2	6	16315	16320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155746
155	NC_021015	AGA	2	6	16406	16411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
156	NC_021015	GTT	2	6	16428	16433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155746
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158	NC_021015	ATG	2	6	16504	16509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155746
159	NC_021015	CAGA	2	8	16569	16576	50 %	0 %	25 %	25 %	479155746
160	NC_021015	AAGA	2	8	16598	16605	75 %	0 %	25 %	0 %	479155746
161	NC_021015	CAGA	2	8	16617	16624	50 %	0 %	25 %	25 %	479155746
162	NC_021015	CGA	2	6	16631	16636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155746
163	NC_021015	TGG	2	6	16662	16667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155746
164	NC_021015	ACG	2	6	16669	16674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155746
165	NC_021015	GAA	2	6	16677	16682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
166	NC_021015	GAA	2	6	16688	16693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
167	NC_021015	AAAG	2	8	16733	16740	75 %	0 %	25 %	0 %	479155746
168	NC_021015	CAGAA	2	10	16846	16855	60 %	0 %	20 %	20 %	479155746
169	NC_021015	GAA	3	9	16875	16883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
170	NC_021015	GATG	2	8	16887	16894	25 %	25 %	50 %	0 %	479155746
171	NC_021015	A	6	6	16965	16970	100 %	0 %	0 %	0 %	479155746
172	NC_021015	GTA	2	6	17013	17018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155746
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178	NC_021015	GACC	2	8	17218	17225	25 %	0 %	25 %	50 %	479155747
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181	NC_021015	TGG	2	6	17478	17483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155747
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184	NC_021015	TAT	2	6	17607	17612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155747
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188	NC_021015	AG	3	6	17877	17882	50 %	0 %	50 %	0 %	479155747
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194	NC_021015	TGG	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155747
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196	NC_021015	TG	3	6	18328	18333	0 %	50 %	50 %	0 %	479155747
197	NC_021015	AC	3	6	18340	18345	50 %	0 %	0 %	50 %	479155747
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199	NC_021015	AAT	2	6	18441	18446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155747
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209	NC_021015	TGC	2	6	18963	18968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155748
210	NC_021015	CAG	2	6	19003	19008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155748
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213	NC_021015	AAAT	2	8	19145	19152	75 %	25 %	0 %	0 %	479155748
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222	NC_021015	TTTC	2	8	19750	19757	0 %	75 %	0 %	25 %	479155748
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238	NC_021015	CAG	2	6	21656	21661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155750
239	NC_021015	ACA	2	6	21675	21680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155750
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242	NC_021015	AAT	2	6	21912	21917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155750
243	NC_021015	GA	3	6	21992	21997	50 %	0 %	50 %	0 %	479155750
244	NC_021015	AGC	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155750
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246	NC_021015	AAGA	2	8	22089	22096	75 %	0 %	25 %	0 %	479155750
247	NC_021015	GA	3	6	22109	22114	50 %	0 %	50 %	0 %	479155750
248	NC_021015	CAA	2	6	22508	22513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155751
249	NC_021015	GAT	2	6	22562	22567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155751
250	NC_021015	GCA	2	6	22644	22649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155751
251	NC_021015	A	6	6	22764	22769	100 %	0 %	0 %	0 %	479155751
252	NC_021015	GCA	2	6	22770	22775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155751
253	NC_021015	GTTT	2	8	22821	22828	0 %	75 %	25 %	0 %	479155751
254	NC_021015	TGC	2	6	22920	22925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155751
255	NC_021015	ATT	2	6	22941	22946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155751
256	NC_021015	TTCTT	2	10	22947	22956	0 %	80 %	0 %	20 %	479155751
257	NC_021015	TTA	2	6	22968	22973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155751
258	NC_021015	GGT	2	6	23012	23017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155751
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260	NC_021015	AT	3	6	23192	23197	50 %	50 %	0 %	0 %	479155751
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